38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0043 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 315 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.65 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.09 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  32.92 
 
 		 249 aa  86.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  34.63 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  34.12 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  32.7 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  31.84 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  30.8 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  31.84 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  31.31 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  31.31 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  31.31 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  29.07 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  31.31 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  34.64 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.91 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  30.36 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  31.31 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  31.31 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  31.31 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  31.31 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.31 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  37.01 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  33.33 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  30.81 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  31.31 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  29.9 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.08 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  31.37 
 
 		 514 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  30.82 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  25.77 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  39.73 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  35.71 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  42.19 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  36.78 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  41.18 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.48 
 
 		 386 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>