43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1905 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  99.22 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  75.44 
 
 		 235 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  74.68 
 
 		 239 aa  353  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  73.93 
 
 		 239 aa  352  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  70.56 
 
 		 262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  70.56 
 
 		 262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  70.56 
 
 		 262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  70.56 
 
 		 262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  70.56 
 
 		 242 aa  337  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  70.56 
 
 		 262 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  70.13 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  70.13 
 
 		 242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  70.13 
 
 		 242 aa  335  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  69.7 
 
 		 242 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  69.26 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  69.26 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  68.4 
 
 		 237 aa  333  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  69.26 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  69.26 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  68.86 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  65.22 
 
 		 249 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  58.95 
 
 		 236 aa  279  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  57.21 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.37 
 
 		 262 aa  92  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.82 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.07 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.84 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.96 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 514 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.95 
 
 		 406 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.86 
 
 		 379 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.09 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.27 
 
 		 606 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.27 
 
 		 606 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.77 
 
 		 453 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.08 
 
 		 618 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.78 
 
 		 398 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.5 
 
 		 500 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.89 
 
 		 773 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.08 
 
 		 506 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.18 
 
 		 365 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.36 
 
 		 384 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>