39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2602 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  100 
 
 		 239 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  94.14 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  74.68 
 
 		 256 aa  353  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  74.25 
 
 		 256 aa  350  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  74.67 
 
 		 235 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  70.51 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  70.51 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  70.51 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  70.51 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  70.51 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  72.89 
 
 		 242 aa  339  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  73.33 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  72.89 
 
 		 242 aa  337  7e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  72.44 
 
 		 242 aa  337  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  72.44 
 
 		 242 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  72.44 
 
 		 242 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  72.89 
 
 		 242 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  72.44 
 
 		 242 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  72.44 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  69.74 
 
 		 237 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  65.5 
 
 		 249 aa  320  8e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  65.69 
 
 		 243 aa  320  9.000000000000001e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  54.94 
 
 		 236 aa  264  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  54.01 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.71 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.5 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.43 
 
 		 424 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  28 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  31.09 
 
 		 514 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.91 
 
 		 500 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.44 
 
 		 453 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.56 
 
 		 406 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.46 
 
 		 606 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.18 
 
 		 432 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.12 
 
 		 615 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.46 
 
 		 606 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  40 
 
 		 618 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.63 
 
 		 506 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>