62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1433 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 		 320 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  71.47 
 
 		 306 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  70.55 
 
 		 304 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  66.56 
 
 		 325 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  61.27 
 
 		 305 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  61.9 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  59.37 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  60.19 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  57.91 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  57.28 
 
 		 311 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  59.54 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  56.97 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  57.28 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  59.94 
 
 		 302 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  58.68 
 
 		 312 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  57.19 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  56.66 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  52.1 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  58.82 
 
 		 311 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  58.2 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  58.2 
 
 		 311 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  58.2 
 
 		 311 aa  358  8e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  58.01 
 
 		 303 aa  338  7e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  53.29 
 
 		 306 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  51.75 
 
 		 306 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  50 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  56.93 
 
 		 190 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  52.04 
 
 		 115 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  24.35 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  24.35 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  23.91 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  34.52 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  24.02 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  34.52 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  34.52 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  34.52 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  34.52 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  32.53 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.06 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.55 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.25 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.26 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.56 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  31.71 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.64 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  35.42 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.67 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  29.01 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  30.77 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  30.77 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.59 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.71 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  24.51 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  28.68 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.53 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3296  hypothetical protein  29.61 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.69 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  23.96 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.4 
 
 		 344 aa  42.4  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>