130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1767 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
356 aa  716    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  63.11 
 
 
354 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  61.52 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  60 
 
 
344 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  56.76 
 
 
343 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  57.96 
 
 
359 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  55.36 
 
 
345 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.23 
 
 
348 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  52.14 
 
 
355 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  53.67 
 
 
356 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.79 
 
 
349 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.68 
 
 
346 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  54.71 
 
 
342 aa  362  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  54.71 
 
 
342 aa  362  6e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  56.81 
 
 
353 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  50.73 
 
 
364 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.95 
 
 
340 aa  355  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.41 
 
 
355 aa  354  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.27 
 
 
341 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  51.03 
 
 
362 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.3 
 
 
346 aa  346  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.15 
 
 
350 aa  345  7e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.02 
 
 
345 aa  335  9e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.4 
 
 
337 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.27 
 
 
336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3660  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.64 
 
 
320 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  47.23 
 
 
338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.43 
 
 
337 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.43 
 
 
337 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.43 
 
 
337 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.13 
 
 
337 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.43 
 
 
337 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.43 
 
 
337 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  47.13 
 
 
337 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.53 
 
 
337 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.13 
 
 
337 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1563  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  43.28 
 
 
345 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  42.59 
 
 
371 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1417  hypothetical protein  41.82 
 
 
333 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.49 
 
 
326 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.19 
 
 
426 aa  233  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  34.25 
 
 
334 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  40.14 
 
 
510 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.63 
 
 
481 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2075  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.42 
 
 
339 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.763346  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1973  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.15 
 
 
345 aa  186  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0907521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3124  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.03 
 
 
385 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0932  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.04 
 
 
366 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.32 
 
 
354 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1798  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.62 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000544657  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.91 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.7 
 
 
318 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.13 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.65 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.53 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.47 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.33 
 
 
346 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.96 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.33 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4403  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.22 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4117  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.67 
 
 
332 aa  92.8  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.28 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0643  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.71 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0486268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.55 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.76 
 
 
333 aa  86.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  27.8 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  27.05 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000043  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.45 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  27.69 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.2 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.87 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  28.38 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.78 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05665  hypothetical protein  25.83 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  28.38 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.38 
 
 
494 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  28.38 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  28.38 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.38 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  28.38 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4379  ectoine utilization protein EutE  27.4 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3423  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.61 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.39 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.72 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  25.18 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3856  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.09 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.404909  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  26.09 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4317  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.925713 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.93 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.69 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.59 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0058  hypothetical protein  29.21 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  25.27 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3861  ectoine utilization protein EutE  33.58 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1538  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.34 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.51 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2148  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.67 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2891  hypothetical protein  60.78 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.231662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>