128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5425 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
337 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  73.11 
 
 
346 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  68.84 
 
 
338 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  43.73 
 
 
335 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  43.12 
 
 
335 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  42.07 
 
 
334 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4423  hypothetical protein  43.25 
 
 
331 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3466  ectoine utilization protein EutE  40.85 
 
 
342 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681288  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  40.66 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.12 
 
 
344 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.84 
 
 
333 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3861  ectoine utilization protein EutE  42.46 
 
 
345 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1538  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.87 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3178  hypothetical protein  40.24 
 
 
335 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.860392  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3856  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.17 
 
 
357 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.404909  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4317  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.17 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.925713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  41.54 
 
 
494 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.54 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.42 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  41.54 
 
 
412 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  41.25 
 
 
340 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  41.25 
 
 
340 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  41.25 
 
 
343 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  41.25 
 
 
340 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  41.25 
 
 
403 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4379  ectoine utilization protein EutE  41.67 
 
 
333 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3941  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.07 
 
 
344 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.07 
 
 
344 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5881  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.07 
 
 
344 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.09 
 
 
338 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5802  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.38 
 
 
342 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6166  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.38 
 
 
342 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.95 
 
 
346 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6647  ectoine utilization protein EutE  42.07 
 
 
342 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6021  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.38 
 
 
341 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5777  ectoine utilization protein EutE  42.38 
 
 
341 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0434759  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  42.64 
 
 
332 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0058  hypothetical protein  40.87 
 
 
349 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  37.65 
 
 
346 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.34 
 
 
334 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6142  ectoine utilization protein EutE  42.2 
 
 
346 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2694  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.01 
 
 
330 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.620459  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2148  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.12 
 
 
343 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7662  putative succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.08 
 
 
348 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.28 
 
 
330 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.65 
 
 
337 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  31.1 
 
 
362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  30.92 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0705  hypothetical protein  46.15 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  29.61 
 
 
355 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  28.67 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.54 
 
 
359 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  28.76 
 
 
334 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.24 
 
 
346 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.18 
 
 
344 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.07 
 
 
348 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3660  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27 
 
 
320 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.03 
 
 
346 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.57 
 
 
350 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.26 
 
 
355 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.15 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.6 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4403  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.15 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.47 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.04 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.38 
 
 
354 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.9 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  28.25 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  34.83 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.84 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.72 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.1 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  29.31 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.96 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.47 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.01 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28 
 
 
340 aa  89.4  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1417  hypothetical protein  25.68 
 
 
333 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1798  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.21 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000544657  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.74 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1563  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  24.66 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.71 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.71 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.8 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.8 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.8 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  26.35 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.21 
 
 
337 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.69 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  26.62 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  26.62 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.08 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000043  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.18 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.27 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.79 
 
 
481 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4117  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.32 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.37 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.83 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.92 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.14 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>