169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3665 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
340 aa  695    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  69.07 
 
 
345 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  65.76 
 
 
341 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  62.46 
 
 
346 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  61.01 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  61.63 
 
 
349 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.06 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.95 
 
 
356 aa  355  5e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.19 
 
 
348 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  50.14 
 
 
355 aa  345  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.27 
 
 
354 aa  342  8e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  50.92 
 
 
356 aa  339  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  51.62 
 
 
362 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  48.37 
 
 
364 aa  328  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  51.9 
 
 
342 aa  326  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  51.9 
 
 
342 aa  326  3e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.8 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.31 
 
 
359 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.79 
 
 
346 aa  315  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.11 
 
 
350 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  50.45 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.15 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.45 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.15 
 
 
337 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.15 
 
 
337 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.34 
 
 
337 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.15 
 
 
337 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.15 
 
 
337 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.15 
 
 
337 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.85 
 
 
337 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.42 
 
 
353 aa  305  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.73 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.65 
 
 
355 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.43 
 
 
345 aa  299  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  47.29 
 
 
338 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3660  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.06 
 
 
320 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  42.22 
 
 
371 aa  276  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1563  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  40.96 
 
 
345 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.22 
 
 
326 aa  230  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  37.14 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.86 
 
 
426 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  39.73 
 
 
510 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1417  hypothetical protein  36.31 
 
 
333 aa  212  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.86 
 
 
481 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3124  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.7 
 
 
385 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2075  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.28 
 
 
339 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.763346  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0932  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.17 
 
 
366 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1973  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.69 
 
 
345 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0907521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1798  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.47 
 
 
332 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000544657  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.06 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.94 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.31 
 
 
318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.55 
 
 
318 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 
318 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.3 
 
 
319 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000043  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.99 
 
 
331 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05665  hypothetical protein  27.59 
 
 
331 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.43 
 
 
333 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.21 
 
 
346 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.26 
 
 
345 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0643  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.83 
 
 
314 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0486268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.52 
 
 
320 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.77 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.01 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  28.74 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3423  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.81 
 
 
401 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4317  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.74 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.925713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.69 
 
 
338 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  34.62 
 
 
346 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3856  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.41 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.404909  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.89 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.21 
 
 
311 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28 
 
 
337 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.21 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3861  ectoine utilization protein EutE  29.75 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.24 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.73 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  27.95 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4379  ectoine utilization protein EutE  28.21 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  27.95 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1538  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.39 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  27.95 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  27.95 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  27.95 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  27.95 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3178  hypothetical protein  28.44 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.860392  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.19 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5881  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.97 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  27.95 
 
 
494 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3941  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.97 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.97 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  26.28 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.99 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.66 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2694  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.09 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.620459  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6647  ectoine utilization protein EutE  27.42 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  28.76 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5802  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.09 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6166  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.09 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.57 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>