124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0643 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0643  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
314 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0486268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
320 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22830  predicted deacylase  29.43 
 
 
345 aa  132  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1755  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.67 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.23 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3353  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.81 
 
 
311 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890946  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22840  predicted deacylase  28.72 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.83 
 
 
340 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  28.77 
 
 
338 aa  99.4  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.9 
 
 
346 aa  99  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.86 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.19 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  27.55 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.1 
 
 
348 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.44 
 
 
344 aa  94  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.64 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.72 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.91 
 
 
348 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3660  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.64 
 
 
320 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  27.7 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  27.7 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1417  hypothetical protein  25.57 
 
 
333 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.72 
 
 
426 aa  89.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.88 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.42 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  26.92 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.24 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.92 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.92 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.92 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.55 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.35 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1563  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  25.76 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  27.83 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.57 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.6 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  27.83 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.92 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.92 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  28.71 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.66 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.5 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1538  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.48 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  27.54 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.26 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.39 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.42 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.09 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  26.46 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5881  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.19 
 
 
344 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  27.17 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  27.17 
 
 
494 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  26.41 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3941  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.69 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.69 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4317  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.69 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.925713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3856  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.3 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.404909  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  22.62 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3861  ectoine utilization protein EutE  28.84 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  26.77 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.98 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  26.77 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  26.77 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  26.77 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  26.77 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.42 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.65 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.81 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0058  hypothetical protein  28.37 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.89 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1973  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.44 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0907521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.67 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.32 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.75 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.52 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4423  hypothetical protein  24.66 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  29 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.24 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.51 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.54 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.88 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000043  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.1 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  27.67 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2148  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.09 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  26.54 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.42 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.27 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2075  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.4 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.763346  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.49 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  27.95 
 
 
332 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3466  ectoine utilization protein EutE  27.32 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681288  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  28 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0932  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.45 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7662  putative succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.6 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.56 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.99 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.44 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5802  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.73 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6166  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.73 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  32.46 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>