122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0058 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0058  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3861  ectoine utilization protein EutE  82.18 
 
 
345 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6142  ectoine utilization protein EutE  79.02 
 
 
346 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6021  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  76.66 
 
 
341 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5777  ectoine utilization protein EutE  76.66 
 
 
341 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0434759  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2148  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  75.36 
 
 
343 aa  544  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6647  ectoine utilization protein EutE  75.93 
 
 
342 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5802  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  75.36 
 
 
342 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6166  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  75.36 
 
 
342 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4423  hypothetical protein  65.79 
 
 
331 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4379  ectoine utilization protein EutE  67.75 
 
 
333 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  64.41 
 
 
335 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  63.31 
 
 
334 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3466  ectoine utilization protein EutE  61.42 
 
 
342 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681288  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  64.71 
 
 
335 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3178  hypothetical protein  62.87 
 
 
335 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.860392  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2694  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  60 
 
 
330 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.620459  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  60.77 
 
 
333 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  57.23 
 
 
335 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  60.7 
 
 
338 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.22 
 
 
330 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.76 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.28 
 
 
346 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41 
 
 
346 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  38.28 
 
 
346 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.18 
 
 
337 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.46 
 
 
344 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.36 
 
 
338 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7662  putative succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.82 
 
 
348 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  36.8 
 
 
494 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  36.8 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  36.5 
 
 
343 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  36.5 
 
 
340 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  36.5 
 
 
340 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  36.5 
 
 
403 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  36.5 
 
 
340 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3856  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.8 
 
 
357 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.404909  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1538  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.69 
 
 
346 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4317  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.5 
 
 
346 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.925713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.01 
 
 
344 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5881  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.4 
 
 
344 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3941  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.4 
 
 
344 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.4 
 
 
344 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.42 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  36.55 
 
 
332 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.43 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0705  hypothetical protein  44.7 
 
 
255 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  30.34 
 
 
334 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4117  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.48 
 
 
332 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.81 
 
 
349 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.23 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.23 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.23 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  30.23 
 
 
337 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.23 
 
 
337 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.23 
 
 
337 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.12 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.84 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.18 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  28.05 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.47 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4403  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.07 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  28.38 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.07 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.82 
 
 
346 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  30.55 
 
 
338 aa  87  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.95 
 
 
326 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2075  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.16 
 
 
339 aa  85.9  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.763346  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.78 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.46 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.14 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  27.19 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  28.01 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.54 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  26.71 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.67 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.92 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.79 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.31 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.9 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.77 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.48 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.29 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.53 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1798  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.57 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000544657  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.66 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.86 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.32 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.16 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3124  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.57 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1973  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.28 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0907521 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.3 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.96 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  27.62 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.5 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.21 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0932  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.78 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  26.49 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  26.49 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>