46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2122 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  64.67 
 
 		 306 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  64.55 
 
 		 305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  63.55 
 
 		 305 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  63.28 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  62.95 
 
 		 311 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  62.99 
 
 		 314 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  62.58 
 
 		 312 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  63.79 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  62.01 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  62.34 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  64.03 
 
 		 311 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  64.03 
 
 		 311 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  64.36 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  63.37 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  60.94 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  59.6 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  59.12 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  58.01 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  58.78 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  57.24 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  59.74 
 
 		 302 aa  348  7e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  56.42 
 
 		 306 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  56.55 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  55.33 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  48.71 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  68.95 
 
 		 190 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  57.45 
 
 		 115 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  27.67 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  27.67 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  36.96 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  33.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  33.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  33.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  33.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  37.68 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  34.26 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  37.14 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  36.47 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  31.07 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  31.07 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  28.47 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  24.49 
 
 		 365 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.61 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.67 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>