43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0725 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  68.27 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  67.53 
 
 		 275 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  67.16 
 
 		 275 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  67.16 
 
 		 275 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  66.79 
 
 		 275 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  67.16 
 
 		 275 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  66.79 
 
 		 275 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  66.79 
 
 		 275 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  66.67 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  66.79 
 
 		 275 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  66.18 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  32.37 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  34.96 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  29.35 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  31.71 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  33.33 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  26.55 
 
 		 305 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  21.76 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  26.61 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  33.33 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  30.83 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  31.16 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  33.33 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  27.56 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  27.66 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  29.08 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  27.74 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  28.46 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  28.93 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  23.35 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  30.08 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  29.27 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  27.64 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  31.4 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  31.96 
 
 		 365 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.4 
 
 		 506 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  28 
 
 		 599 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.31 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>