57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2208 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 		 362 aa  754    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  54.76 
 
 		 304 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  52.84 
 
 		 306 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  52.74 
 
 		 301 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  52.6 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  52.1 
 
 		 320 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  49.42 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  49.13 
 
 		 305 aa  341  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  50.85 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  49.71 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  48.42 
 
 		 311 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  47.85 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  47.85 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  47.28 
 
 		 314 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  47.28 
 
 		 311 aa  322  7e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  48.41 
 
 		 302 aa  317  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  48.27 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  48.08 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  47.14 
 
 		 311 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  46.86 
 
 		 311 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  46.29 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  46.86 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  44.76 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  48.71 
 
 		 303 aa  299  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  42.9 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  41.09 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  54.76 
 
 		 190 aa  232  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  38.21 
 
 		 115 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  29.25 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  32.94 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  32.94 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  32.94 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  29.37 
 
 		 274 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  33.75 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  32.14 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.91 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  37.04 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.93 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.89 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  30.77 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.38 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.65 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.8 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.01 
 
 		 631 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4458  hypothetical protein  25.19 
 
 		 584 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.86 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  28.4 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  29.11 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.38 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.4 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.85 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.58 
 
 		 355 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>