49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2526 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  69.96 
 
 		 275 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  70.33 
 
 		 275 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  69.96 
 
 		 275 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  69.96 
 
 		 275 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  69.96 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  69.96 
 
 		 275 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  69.96 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  69.96 
 
 		 275 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  69.96 
 
 		 275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  64.42 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  66.18 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  29.11 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  29.37 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  29.66 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  34.26 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  32.53 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  28.68 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  31.11 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  29.46 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  35.29 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  28.28 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  26.88 
 
 		 305 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  27.91 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  26.36 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  33.75 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  30.97 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  27.75 
 
 		 309 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  30.67 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  23.96 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  29.33 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  29.23 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.76 
 
 		 599 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  25.93 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  34.57 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.3 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.89 
 
 		 506 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  33.33 
 
 		 365 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  31.73 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.29 
 
 		 618 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.14 
 
 		 606 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.14 
 
 		 606 aa  42.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.89 
 
 		 585 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.21 
 
 		 634 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>