51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2333 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  61.76 
 
 		 306 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  62.25 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  57.91 
 
 		 320 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  58.5 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  57.38 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  57.05 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  60.28 
 
 		 309 aa  361  9e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  56.38 
 
 		 302 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  57.62 
 
 		 306 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  56.42 
 
 		 301 aa  352  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  58.61 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  54.93 
 
 		 311 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  53.95 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  53.75 
 
 		 314 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  53.09 
 
 		 314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  53.4 
 
 		 314 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  55.48 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  55.48 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  55.48 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  55.48 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  52.82 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  56.42 
 
 		 303 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  48.27 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  49.83 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  50.51 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  60.75 
 
 		 190 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  50.49 
 
 		 115 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  25.57 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  24.77 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  24.77 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  29.11 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  23.85 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  28.14 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  24.31 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  28.81 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  28.81 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  28.81 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  28.81 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  23.35 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  36.25 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.02 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.02 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.02 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.02 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.99 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.93 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.99 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.99 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.99 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  32.99 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>