57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001335 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  92.13 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  69.31 
 
 		 312 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  65.25 
 
 		 306 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  65.99 
 
 		 304 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  63.9 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  63.9 
 
 		 314 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  64.52 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  62.62 
 
 		 306 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  62.62 
 
 		 314 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  63.55 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  61.27 
 
 		 320 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  64.08 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  63.11 
 
 		 311 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  63.11 
 
 		 311 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  59.67 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  61.2 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  63.11 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  60.33 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  63.55 
 
 		 303 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  61.38 
 
 		 309 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  61.74 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  57.38 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  49.42 
 
 		 362 aa  346  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  55.92 
 
 		 306 aa  341  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  53.47 
 
 		 309 aa  332  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  75 
 
 		 190 aa  297  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  69.39 
 
 		 115 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  27.74 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  26.88 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.36 
 
 		 393 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  32.5 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  30.85 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  26.92 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  26.92 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  26.72 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  23.88 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.64 
 
 		 631 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.38 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  25 
 
 		 341 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  23.13 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  23.13 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  23.13 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  24.19 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 606 aa  42.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 606 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>