41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1954 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  96.82 
 
 
314 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  95.86 
 
 
314 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  94.27 
 
 
311 aa  613  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  88.54 
 
 
311 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  85.26 
 
 
311 aa  534  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  84.94 
 
 
311 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  84.29 
 
 
311 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  84.29 
 
 
311 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  62.62 
 
 
305 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  62.21 
 
 
305 aa  401  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  62.18 
 
 
306 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  56.66 
 
 
320 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  59.02 
 
 
304 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  59.42 
 
 
312 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  62.99 
 
 
303 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  57.01 
 
 
306 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  55.05 
 
 
306 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  55.52 
 
 
325 aa  349  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  55.08 
 
 
302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  53.4 
 
 
306 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  51.96 
 
 
301 aa  332  5e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  47.28 
 
 
362 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  52.88 
 
 
306 aa  322  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  52.01 
 
 
309 aa  318  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  51.63 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  66.15 
 
 
190 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  51.46 
 
 
115 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  25.74 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  25.74 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  30.09 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  33.75 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.17 
 
 
350 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>