31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1975 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 		 342 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  90.56 
 
 		 341 aa  617  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  90.86 
 
 		 341 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  89.97 
 
 		 346 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  85.55 
 
 		 342 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  84.71 
 
 		 342 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  84.71 
 
 		 342 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  83.78 
 
 		 342 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  65.07 
 
 		 340 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  60.54 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  44.67 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  46.05 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.31 
 
 		 344 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  46.87 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  42.51 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  43.88 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  43.75 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  41.92 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  43.11 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  43.37 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  44.52 
 
 		 343 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  42.09 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  41.56 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.36 
 
 		 606 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.36 
 
 		 606 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.99 
 
 		 618 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.06 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.99 
 
 		 506 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.33 
 
 		 821 aa  46.6  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  29.21 
 
 		 309 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>