39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4852 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  497  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  49.68 
 
 
217 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  48.41 
 
 
217 aa  158  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  47.74 
 
 
217 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  47.74 
 
 
217 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  47.74 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  47.71 
 
 
217 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  43.84 
 
 
219 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  54.61 
 
 
238 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  51.41 
 
 
228 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  33.18 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  42.78 
 
 
260 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  46.79 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  33.72 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  36.81 
 
 
165 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  40.94 
 
 
221 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  32.46 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  32.93 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  30.71 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  32.26 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  30.67 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  35.29 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  31.1 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  32.26 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  30.06 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  33.7 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  27.84 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  31.79 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  31.33 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  30.37 
 
 
220 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  31.28 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  27.65 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  30 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  29.85 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  32.92 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  30.63 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  30.64 
 
 
273 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  24.32 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>