24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6704 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  60 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  32.1 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  28.87 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  29.38 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  32.1 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  31.48 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  31.48 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  29.81 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  27.78 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  30.36 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  31.65 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  33.63 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  27.06 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  28 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  27.89 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  24.06 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  21.66 
 
 		 220 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  30.28 
 
 		 220 aa  45.1  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  26.95 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  25.74 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  27.74 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  24.57 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  24.05 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>