36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1806 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  52.53 
 
 
270 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  47.79 
 
 
280 aa  262  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  47.88 
 
 
215 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3230  hypothetical protein  46.34 
 
 
232 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.760608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  30.83 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3329  hypothetical protein  45.45 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4055  hypothetical protein  46.67 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591615  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  35.26 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  29.39 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  31.93 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  30.13 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  30.95 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  28.21 
 
 
217 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  28.21 
 
 
217 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  29.75 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  28.39 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  28.39 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  25.37 
 
 
226 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  26.63 
 
 
219 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  28.66 
 
 
165 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  35.58 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  27.47 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  30.63 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  30.25 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  29.56 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  26.06 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  27.49 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  25.47 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  30.88 
 
 
212 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  30.08 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  28.15 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  27.75 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  29.58 
 
 
356 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>