30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0833 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  39.64 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  51.61 
 
 		 165 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  40.94 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  31.98 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  31.19 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  30.69 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  37.01 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  30.69 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  30.69 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  30.46 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  32.02 
 
 		 308 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  32.62 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  32.91 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  30.23 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  29.87 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  34 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  29.19 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  30.13 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  29.44 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  30.63 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  29.73 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  30.52 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  28.85 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  28.1 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  31.78 
 
 		 280 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  26.14 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  28.48 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>