40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0531 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  50.31 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  39.49 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  46.45 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  37.78 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  38.22 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  38.22 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  38.06 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  38.02 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  43.59 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  36.65 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  31.1 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  33.76 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  31.9 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  31.69 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  32.23 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  31.4 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  31.74 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  32.3 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  35.4 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  32.99 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  33.12 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  30.95 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  30.13 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  27.89 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  29.19 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  34.52 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3230  hypothetical protein  34.66 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.760608 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3329  hypothetical protein  33.83 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4055  hypothetical protein  34.83 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  28.47 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  26.22 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  27.36 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  33.98 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  31.28 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  25.64 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>