47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1575 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  49.34 
 
 
260 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  42.48 
 
 
239 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  40.49 
 
 
237 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  45.02 
 
 
220 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  38.08 
 
 
238 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  46.63 
 
 
223 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  38 
 
 
212 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  34.04 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  33.61 
 
 
356 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  32.02 
 
 
221 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  35.8 
 
 
228 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  31.69 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  30.71 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  31.53 
 
 
217 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  31.53 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  31.53 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  30.63 
 
 
217 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  30.63 
 
 
217 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  30.73 
 
 
223 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  27.19 
 
 
226 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  34.75 
 
 
238 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  29.94 
 
 
211 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  30.71 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  36.11 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  29.19 
 
 
214 aa  52.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  25.6 
 
 
165 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  25.83 
 
 
273 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  28.95 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  29.94 
 
 
235 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  34.82 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  25.52 
 
 
212 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2090  hypothetical protein  36.36 
 
 
523 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1297  hypothetical protein  36.36 
 
 
528 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0690  hypothetical protein  36.36 
 
 
523 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2204  hypothetical protein  36.36 
 
 
528 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2522  hypothetical protein  36.36 
 
 
523 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  27.96 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1133  hypothetical protein  35.45 
 
 
523 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  32.38 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1141  hypothetical protein  35.45 
 
 
528 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  27.83 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  42.86 
 
 
1281 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  30.08 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>