31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2418 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  34.64 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  37.27 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  25.47 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  32.26 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  34.38 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  29.34 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  30.77 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  29.52 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  29.7 
 
 
217 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  29.7 
 
 
217 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  29.09 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  27.89 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  29.09 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  31.55 
 
 
237 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  29.23 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  28.82 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  28.8 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  32.73 
 
 
260 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  31.01 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  27.85 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  27.95 
 
 
270 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  29.68 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  29.79 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  28.21 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  26.62 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  24.05 
 
 
212 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  28.4 
 
 
238 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  36.59 
 
 
249 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>