25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2277 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  60 
 
 
212 aa  255  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  31.33 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  26.16 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  29.27 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  26.51 
 
 
308 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  32.08 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  33.15 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  32.52 
 
 
260 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  26.26 
 
 
238 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  24.75 
 
 
217 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  24.75 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  24.75 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  24.68 
 
 
217 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  29.57 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  24.68 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  25.32 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  27.85 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  32.74 
 
 
227 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  28.87 
 
 
280 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  26.28 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  29.2 
 
 
238 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  27.67 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  23.03 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>