37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5958 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  49.75 
 
 
237 aa  221  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  38.08 
 
 
308 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  41.59 
 
 
260 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  39.13 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  33.5 
 
 
220 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  32.65 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  33.33 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  37.11 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  29.61 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  26.61 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  25.84 
 
 
217 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  31.76 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  37.07 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  25.98 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  26.26 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  29.14 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  35.29 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  30.48 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  23.47 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  30.17 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  25.62 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  27.49 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  32.73 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  30.1 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  26.47 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  25.74 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  27.39 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  24.06 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  25.71 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  25.88 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  27.54 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>