31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0710 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3329  hypothetical protein  51.87 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4055  hypothetical protein  53.48 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  47.88 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  48.13 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3230  hypothetical protein  51.85 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.760608 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  43.65 
 
 		 280 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  34.27 
 
 		 275 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  34.78 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  34.52 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  35 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  27.01 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  26.88 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  25.4 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  26.99 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  26.99 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  26.44 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  30.95 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  30.32 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  32.2 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2090  hypothetical protein  25.53 
 
 		 523 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2522  hypothetical protein  25.53 
 
 		 523 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0690  hypothetical protein  25.53 
 
 		 523 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1133  hypothetical protein  24.82 
 
 		 523 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  32.93 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1297  hypothetical protein  25.53 
 
 		 528 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2204  hypothetical protein  25.53 
 
 		 528 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  28.66 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>