17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1133 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2090  hypothetical protein  99.81 
 
 
523 aa  1038    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2204  hypothetical protein  99.62 
 
 
528 aa  1035    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1297  hypothetical protein  99.24 
 
 
528 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0690  hypothetical protein  99.81 
 
 
523 aa  1038    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2522  hypothetical protein  99.81 
 
 
523 aa  1038    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1133  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1038    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1141  hypothetical protein  98.66 
 
 
528 aa  1025    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  30.7 
 
 
238 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  28.95 
 
 
228 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  29.09 
 
 
237 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  35.45 
 
 
308 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  31.54 
 
 
217 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  27.33 
 
 
217 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  29.13 
 
 
273 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  27.66 
 
 
217 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  28.71 
 
 
249 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  23.68 
 
 
227 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>