37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0608 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  62.19 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  61.62 
 
 
254 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  59.42 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  53.67 
 
 
231 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  34.16 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  32.75 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  32.14 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  32.74 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  34.19 
 
 
165 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  33.73 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  30.17 
 
 
212 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  38.05 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  28.65 
 
 
280 aa  55.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  29.13 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  34.76 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  27.65 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  27.88 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  26.06 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  31.5 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1297  hypothetical protein  29.7 
 
 
528 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2204  hypothetical protein  29.7 
 
 
528 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2522  hypothetical protein  29.7 
 
 
523 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0690  hypothetical protein  29.7 
 
 
523 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  31.28 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2090  hypothetical protein  29.7 
 
 
523 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1133  hypothetical protein  28.71 
 
 
523 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1141  hypothetical protein  28.71 
 
 
528 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  27.44 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  28.48 
 
 
221 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  25.94 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  29.32 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  23.25 
 
 
356 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>