24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2467 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  537  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  62.32 
 
 
249 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  51.96 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  54.77 
 
 
235 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  50.23 
 
 
231 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  26.57 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  34.76 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  30.27 
 
 
219 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  26.06 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  32.66 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  26.02 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  25.15 
 
 
217 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  24.85 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  24.24 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  24.55 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  24.55 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1133  hypothetical protein  29.13 
 
 
523 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2090  hypothetical protein  29.13 
 
 
523 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2522  hypothetical protein  29.13 
 
 
523 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0690  hypothetical protein  29.13 
 
 
523 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1297  hypothetical protein  29.13 
 
 
528 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2204  hypothetical protein  29.13 
 
 
528 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1141  hypothetical protein  28.35 
 
 
528 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  26.75 
 
 
246 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>