26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3847 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  59.55 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  51.5 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  55.05 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  45.37 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  34.52 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  27.51 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  27.11 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  28.4 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  26.29 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  25.82 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  31.55 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  32.94 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  27.16 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  31.75 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  27.74 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  23.14 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  29.11 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  26.9 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  24.44 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  27.78 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  28.93 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  29.94 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>