45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3229 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  42.11 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  42.67 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  42.67 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  41.89 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  42.67 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  43.54 
 
 		 217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  39.87 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  41.61 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  31.28 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  31.7 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  36.65 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  32.83 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  31.37 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  31.61 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  24.24 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  25.76 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  28.23 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  29.23 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  31.74 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  27.06 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  29.19 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  27.47 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  27.65 
 
 		 249 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  26.57 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  34 
 
 		 128 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  25.44 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3407  hypothetical protein  31 
 
 		 128 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  29.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  24.85 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  26.28 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  31 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  23.14 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 523 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 523 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0690  hypothetical protein  28.57 
 
 		 523 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1141  hypothetical protein  28.57 
 
 		 528 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1297  hypothetical protein  28.57 
 
 		 528 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2204  hypothetical protein  28.57 
 
 		 528 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  26.32 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1133  hypothetical protein  27.78 
 
 		 523 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>