39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6517 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  52.53 
 
 
275 aa  271  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  50.95 
 
 
280 aa  270  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  48.13 
 
 
215 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  32.45 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3230  hypothetical protein  46.99 
 
 
232 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.760608 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3329  hypothetical protein  46.06 
 
 
242 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4055  hypothetical protein  46.67 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591615  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  35.9 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  30.82 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  30.19 
 
 
217 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  33.14 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  29.56 
 
 
217 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  29.75 
 
 
217 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  29.75 
 
 
217 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  29.11 
 
 
217 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  38.1 
 
 
239 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  31.21 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  32.99 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  35.29 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  36.45 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  33.53 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  28.23 
 
 
214 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  29.7 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  31.13 
 
 
227 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  23.12 
 
 
165 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  27.95 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  23.46 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  32.38 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  28.66 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  26.22 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  27.44 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1141  hypothetical protein  27.82 
 
 
528 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0690  hypothetical protein  27.82 
 
 
523 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2090  hypothetical protein  27.82 
 
 
523 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2522  hypothetical protein  27.82 
 
 
523 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2204  hypothetical protein  27.82 
 
 
528 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1297  hypothetical protein  27.82 
 
 
528 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1133  hypothetical protein  27.07 
 
 
523 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>