31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4047 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  100 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  38 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  42.93 
 
 		 220 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  41.49 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  39.2 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  32.83 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  36.71 
 
 		 260 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  30.73 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  33.12 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  26.9 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  31.72 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  27.43 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  30.05 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  30.17 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  23.71 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  23.71 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  23.71 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  25.15 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  28.85 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  24.54 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  29.68 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  31.85 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  30.88 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  34.15 
 
 		 273 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  27.78 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  32.5 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  25.71 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>