39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1524 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  42.02 
 
 		 308 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  48.46 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  43.56 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  39.75 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  39.22 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  36.02 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  39.23 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  38.97 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  33.61 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  36.2 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  35.1 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  33.66 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  28 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  38.1 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  30.51 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  29.82 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  24.62 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  24.62 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  27.95 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  34.26 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  26.54 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  35.58 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  25.13 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  32.16 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  26.26 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  29.63 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  24.1 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  23.74 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  31.28 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3551  hypothetical protein  29.94 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  27.53 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  34.51 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  31 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  29.38 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  32.71 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  36 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  28.17 
 
 		 231 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>