16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1288 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  32.45 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  30.83 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  28.15 
 
 
280 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  34.27 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3329  hypothetical protein  32.28 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  30.53 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4055  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591615  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3230  hypothetical protein  32.65 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.760608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  27.43 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  36.11 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  31.86 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  26.22 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  26.62 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  29.76 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  29.32 
 
 
249 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>