30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3808 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  39.64 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  45 
 
 
165 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  33.17 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  33.17 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  33.66 
 
 
217 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  33.72 
 
 
251 aa  104  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  31.68 
 
 
217 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  31.68 
 
 
217 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  36.08 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  26.87 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  28 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  32.3 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  31.1 
 
 
228 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  27.32 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  31.61 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  26.78 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  28.48 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  26.85 
 
 
308 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  26.97 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  25.37 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  29.57 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  29.7 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  27.04 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  24.44 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  29.57 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  23.46 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  21.13 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  25.16 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>