18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4840 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4840  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 98 aa  201  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1132  phage transcriptional regulator, AlpA  47.56 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0495  prophage CP4-57 regulatory  47.56 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1467  prophage CP4-57 regulatory  46.34 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1360  phage transcriptional regulator, AlpA  46.05 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104644  hitchhiker  0.00829319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3482  phage transcriptional regulator, AlpA  46.34 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2688  putative DNA-binding protein  48.68 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2489  putative DNA-binding protein  47.3 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2019  prophage CP4-57 regulatory  44.87 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1264  phage transcriptional regulator, AlpA  46.34 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3194  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5687  prophage CP4-57 regulatory  40.54 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1704  prophage CP4-57 regulatory  39.02 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1972  putative DNA-binding protein  39.19 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1999  putative DNA-binding protein  37.04 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.0610566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2946  putative DNA-binding protein  42.47 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.877107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0794  prophage CP4-57 regulatory  42.47 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3363  prophage CP4-57 regulatory  35.62 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>