32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4875 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  78.33 
 
 		 120 aa  197  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  55.3 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  50.83 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  48.41 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  47.9 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  45.16 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  51.85 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  48.15 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  50.83 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  48.96 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  49.58 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  48.74 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  51.96 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2217  hypothetical protein  47.5 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.409261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  49.58 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  36.57 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  45.36 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  37.01 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  37.17 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  36.19 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  38.74 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  39.53 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  25.69 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  31.34 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  32.22 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  28.7 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  34.02 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  30.7 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>