34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3704 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  287  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  50.81 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  47.58 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  47.58 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  47.24 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  47.11 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  48.78 
 
 		 220 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  46.34 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  48.78 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  48.78 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  42.74 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  33.68 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  34.74 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  32.77 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  33.68 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  32.32 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  32.22 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  39.08 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  30.61 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  35.56 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  38.3 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  34.02 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  36.73 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  36.08 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  28.69 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  32.32 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  32.67 
 
 		 132 aa  40  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>