32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3110 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  78.33 
 
 		 142 aa  197  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  63.16 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  50.83 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  50.45 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  47.06 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  47.86 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  48.74 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  51.85 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  50.85 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  53.12 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  51.67 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  45 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  50.96 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  50.45 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  48.65 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  51 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2217  hypothetical protein  48.65 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.409261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  49.55 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  38.68 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  44.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  38.66 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  39.53 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  39.81 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  34.29 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  28.83 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  33.87 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  40.4 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  32.32 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  33.68 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  33.73 
 
 		 123 aa  42  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>