30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0429 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  56.91 
 
 
126 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  56.1 
 
 
125 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  58.47 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  53.91 
 
 
134 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  52.07 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  51.61 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  50.83 
 
 
120 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  50.85 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  50.83 
 
 
123 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  47.5 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  43.86 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  43.44 
 
 
128 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  52.94 
 
 
122 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  42.62 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  48.31 
 
 
123 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2217  hypothetical protein  51.75 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.409261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  45.97 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  43.3 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  34.17 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  43.4 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  34.65 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  46.15 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  38.14 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  37.36 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  29.36 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  34.18 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>