31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2217 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  266  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.409261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  83.33 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  80.83 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  67.77 
 
 		 121 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  82.5 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  68.91 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  65.29 
 
 		 123 aa  139  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  62.5 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  57.94 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  59.66 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  54.55 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  71.57 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  47.5 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  48.65 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  52.54 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  45.08 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  47.06 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  48.28 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  49.5 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  40.62 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  38.1 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  35.78 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  42.22 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  39.77 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  26.61 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  37.61 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  30.28 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  31.58 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>