17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7087 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  100 
 
 
123 aa  236  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  78.51 
 
 
122 aa  187  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  69.67 
 
 
129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  69.67 
 
 
129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  67.48 
 
 
124 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  67.48 
 
 
123 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  67.48 
 
 
123 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  67.48 
 
 
220 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  52.5 
 
 
123 aa  110  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  46.34 
 
 
146 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  38.84 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  38.21 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  38.21 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  39.29 
 
 
131 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  33.7 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  36 
 
 
120 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>