16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4830 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  100 
 
 		 129 aa  251  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  100 
 
 		 129 aa  251  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  69.67 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  69.42 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  66.12 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  60 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  60 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  60 
 
 		 220 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  47.58 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  37.19 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  36.29 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  36.29 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  41.07 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  34.48 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  34.48 
 
 		 125 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>