33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4869 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4869  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4465  auxin-binding protein  57.34 
 
 		 176 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2643  hypothetical protein  47.58 
 
 		 151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2520  hypothetical protein  41.18 
 
 		 122 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1884  hypothetical protein  38.46 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0340066  hitchhiker  0.00256991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0224  hypothetical protein  34.78 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4031  hypothetical protein  43.96 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0608  hypothetical protein  44.64 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2026  hypothetical protein  36.61 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2150  hypothetical protein  41.12 
 
 		 116 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.309277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  40.54 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0726  hypothetical protein  34.48 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.785305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  42.59 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4224  hypothetical protein  43.68 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4984  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2445  hypothetical protein  36.63 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2612  hypothetical protein  37.38 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3900  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1494  hypothetical protein  40.43 
 
 		 112 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1470  hypothetical protein  40.43 
 
 		 112 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3680  hypothetical protein  40.48 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3239  hypothetical protein  36.08 
 
 		 114 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2861  hypothetical protein  39.76 
 
 		 113 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.81286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0905  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1213  hypothetical protein  34.65 
 
 		 139 aa  52.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00326855  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5317  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.552932 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5694  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2595  hypothetical protein  36.46 
 
 		 139 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112687  normal  0.497297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1293  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3211  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718699  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3731  hypothetical protein  27 
 
 		 113 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.959658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2914  hypothetical protein  39.78 
 
 		 128 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0550835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>