3016 genes were found for organism Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CPF_0001  CDS  NC_008261  411  1784  +  1374  chromosomal replication initiation protein  YP_694476  hitchhiker  0.000458864  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0002  CDS  NC_008261  2079  3179  +  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_694477  normal  0.279408  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0003  CDS  NC_008261  3305  3511  +  207  S4 domain-containing protein  YP_694478  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0004  CDS  NC_008261  3567  4652  +  1086  recombination protein F  YP_694479  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0005  CDS  NC_008261  4666  4926  +  261  hypothetical protein  YP_694480  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0006  CDS  NC_008261  5163  7079  +  1917  DNA gyrase subunit B  YP_694481  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0007  CDS  NC_008261  7101  9620  +  2520  DNA gyrase subunit A  YP_694482  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0008  tRNA  NC_008261  14992  15068  +  77  tRNA-Met    normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0009  tRNA  NC_008261  15074  15149  +  76  tRNA-Ala    normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0010  CDS  NC_008261  15422  15925  +  504  hypothetical protein  YP_694483  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0011  CDS  NC_008261  16274  19030  +  2757  hypothetical protein  YP_694484  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0012  CDS  NC_008261  19273  20667  +  1395  FAD-dependent oxidoreductase  YP_694485  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0013  CDS  NC_008261  20680  20913  +  234  hypothetical protein  YP_694486  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0014  CDS  NC_008261  21265  22542  +  1278  seryl-tRNA synthetase  YP_694487  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0015  CDS  NC_008261  22719  23138  +  420  hypothetical protein  YP_694488  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0016  tRNA  NC_008261  23280  23370  +  91  tRNA-Ser    normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0017  tRNA  NC_008261  23404  23494  +  91  tRNA-Ser    normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0018  CDS  NC_008261  23755  24021  +  267  hypothetical protein  YP_694489  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0019  tRNA  NC_008261  24130  24220  +  91  tRNA-Ser    normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0020  tRNA  NC_008261  24226  24316  +  91  tRNA-Ser    normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0021  CDS  NC_008261  24351  24533  -  183  hypothetical protein  YP_694490  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0022  CDS  NC_008261  24771  25652  +  882  hypothetical protein  YP_694491  normal  0.928419  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0023  CDS  NC_008261  25741  25905  -  165  hypothetical protein  YP_694492  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0024  CDS  NC_008261  26114  29590  +  3477  ATP-dependent nuclease, subunit B  YP_694493  normal  0.199779  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0025  CDS  NC_008261  29580  33395  +  3816  ATP-dependent nuclease, subunit A  YP_694494  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0026  CDS  NC_008261  33434  34708  -  1275  polyA polymerase family protein  YP_694495  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0027  CDS  NC_008261  34839  35810  +  972  3'-5' exoribonuclease YhaM  YP_694496  normal  0.838244  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0028  CDS  NC_008261  35842  37002  -  1161  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_694497  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0029  CDS  NC_008261  37194  38414  +  1221  peptidase T  YP_694498  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0030  CDS  NC_008261  38520  39395  -  876  degV family protein  YP_694499  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0031  tRNA  NC_008261  39585  39661  +  77  tRNA-Arg    normal  0.663403  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0032  CDS  NC_008261  39832  40971  +  1140  hypothetical protein  YP_694500  normal  0.65464  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0033  CDS  NC_008261  41086  41970  -  885  phosphatidylserine decarboxylase  YP_694501  normal  0.484885  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0034  CDS  NC_008261  42133  42702  +  570  TetR family transcriptional regulator  YP_694502  normal  0.345685  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0035  tRNA  NC_008261  42757  42831  +  75  tRNA-Arg    normal  0.150876  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0036  CDS  NC_008261  42977  44242  +  1266  putative transporter  YP_694503  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0037  CDS  NC_008261  44245  44676  +  432  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  YP_694504  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0038  CDS  NC_008261  44754  45197  +  444  hypothetical protein  YP_694505  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0039  CDS  NC_008261  45310  45675  +  366  hypothetical protein  YP_694506  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0040  CDS  NC_008261  45836  46447  +  612  hypothetical protein  YP_694507  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0041  CDS  NC_008261  46559  48031  -  1473  hypothetical protein  YP_694508  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0042  CDS  NC_008261  48363  49559  +  1197  phospholipase C  YP_694509  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0043  CDS  NC_008261  49747  50673  +  927  CobW/P47K family protein  YP_694510  normal  0.845125  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0044  CDS  NC_008261  50693  51277  +  585  hypothetical protein  YP_694511  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0045  CDS  NC_008261  51280  52173  +  894  putative permease  YP_694512  normal  0.151776  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0046  CDS  NC_008261  52186  52905  +  720  hypothetical protein  YP_694513  normal  0.142914  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0047  CDS  NC_008261  53171  53959  +  789  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  YP_694514  decreased coverage  0.000638304  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0048  tRNA  NC_008261  54210  54299  +  90  tRNA-Ser    normal  0.0798542  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0049  CDS  NC_008261  54732  55235  +  504  putative lipoprotein  YP_694515  normal  0.369511  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0050  CDS  NC_008261  55675  56961  +  1287  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  YP_694516  normal  0.973041  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0051  CDS  NC_008261  57107  57592  -  486  dihydrofolate reductase  YP_694517  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0052  CDS  NC_008261  57783  59426  +  1644  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_694518  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0053  CDS  NC_008261  59538  59876  +  339  hypothetical protein  YP_694519  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0054  CDS  NC_008261  59974  60570  +  597  recombination protein RecR  YP_694520  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0055  CDS  NC_008261  60796  61074  +  279  hypothetical protein  YP_694521  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0056  CDS  NC_008261  61090  61368  +  279  sigma-K factor processing regulatory protein BofA  YP_694522  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0057  CDS  NC_008261  61643  62788  +  1146  hypothetical protein  YP_694523  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0058  CDS  NC_008261  62939  63118  +  180  hypothetical protein  YP_694524  normal  0.738845  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0059  CDS  NC_008261  63187  63369  +  183  hypothetical protein  YP_694525  normal  0.377754  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0060  CDS  NC_008261  63533  64609  +  1077  aminotransferase, class V  YP_694526  normal  0.138135  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0061  CDS  NC_008261  64678  65583  +  906  putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  YP_694527  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0062  CDS  NC_008261  65733  66989  +  1257  hypothetical protein  YP_694528  normal  0.519667  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0063  CDS  NC_008261  67045  67740  -  696  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  YP_694529  normal  0.720122  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0064  CDS  NC_008261  68118  68879  +  762  HesA/MoeB/ThiF family protein  YP_694530  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0065  CDS  NC_008261  69170  70336  +  1167  major facilitator family transporter  YP_694531  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0066  CDS  NC_008261  70715  71299  +  585  acetyltransferase  YP_694532  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0067  CDS  NC_008261  71391  72002  +  612  deoxyguanosine kinase/deoxyadenosine kinase  YP_694533  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0068  tRNA  NC_008261  77330  77405  +  76  tRNA-Lys    normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0069  CDS  NC_008261  77726  78574  +  849  transcription antiterminator  YP_694534  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0070  CDS  NC_008261  78607  79086  -  480  putative PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIA component  YP_694535  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0071  CDS  NC_008261  79744  81189  +  1446  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  YP_694536  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0072  CDS  NC_008261  81258  81776  -  519  TetR family transcriptional regulator  YP_694537  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0073  tRNA  NC_008261  87165  87239  +  75  tRNA-Asn    normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0074  CDS  NC_008261  87896  89986  +  2091  elongation factor G  YP_694538  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0075  CDS  NC_008261  90409  90645  +  237  hypothetical protein  YP_694539  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0076  CDS  NC_008261  90897  91844  +  948  putative glucokinase  YP_694540  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0077  CDS  NC_008261  92386  92928  +  543  rubredoxin/rubrerythrin  YP_694541  normal  0.165154  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0078  CDS  NC_008261  93261  93884  +  624  phosphoglycerate mutase family protein  YP_694542  normal  0.570626  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0079  CDS  NC_008261  94243  95013  -  771  putative transcriptional regulator IolR  YP_694543  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0080  CDS  NC_008261  95495  96649  +  1155  alcohol dehydrogenase, iron-containing  YP_694544  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0081  CDS  NC_008261  96656  97501  +  846  fructose-bisphosphate aldolase  YP_694545  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0082  CDS  NC_008261  97515  98531  +  1017  myo-inositol catabolism protein IolC  YP_694546  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0083  CDS  NC_008261  98545  99312  +  768  putative myo-inositol catabolism protein IolB  YP_694547  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0084  CDS  NC_008261  99329  101248  +  1920  myo-inositol catabolism protein IolD  YP_694548  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0085  CDS  NC_008261  101318  102325  +  1008  myo-inositol 2-dehydrogenase  YP_694549  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0086  CDS  NC_008261  102444  103337  +  894  myo-inositol catabolism protein IolE  YP_694550  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0087  CDS  NC_008261  103419  105008  +  1590  putative symporter YidK  YP_694551  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0088  CDS  NC_008261  105096  106145  +  1050  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  YP_694552  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0089  CDS  NC_008261  106517  107275  +  759  formate/nitrite transporter family protein  YP_694553  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0090  CDS  NC_008261  107507  108283  +  777  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  YP_694554  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0091  CDS  NC_008261  108386  109936  +  1551  propionate CoA-transferase  YP_694555  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0092  CDS  NC_008261  110040  111176  +  1137  butyryl-CoA dehydrogenase  YP_694556  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0093  CDS  NC_008261  111587  111937  -  351  hypothetical protein  YP_694557  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0094  CDS  NC_008261  112515  113645  +  1131  glycerol dehydrogenase  YP_694558  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0095  CDS  NC_008261  113671  115419  +  1749  dihydroxyacetone kinase  YP_694559  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0096  CDS  NC_008261  115780  117213  +  1434  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_694560  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0097  CDS  NC_008261  117490  117762  +  273  hypothetical protein  YP_694561  normal  1  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0098  CDS  NC_008261  118161  119114  -  954  L-lactate dehydrogenase  YP_694562  normal  0.409551  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0099  CDS  NC_008261  119740  120915  +  1176  hypothetical protein  YP_694563  normal  0.0965703  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0100  CDS  NC_008261  121034  121474  +  441  hypothetical protein  YP_694564  hitchhiker  0.000653805  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>