18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0022 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  98.63 
 
 
293 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  41.75 
 
 
299 aa  254  9e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  40.14 
 
 
317 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  41.32 
 
 
298 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  36.63 
 
 
296 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
360 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  23.15 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  27.1 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  26.03 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  26.41 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  26.13 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  25.82 
 
 
357 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  24.68 
 
 
357 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1083  metallophosphoesterase  22.64 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0304691  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0190  hypothetical protein  25.86 
 
 
395 aa  43.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>