92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0083 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  100 
 
 		 255 aa  526  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  51.57 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  52.96 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  52.57 
 
 		 263 aa  291  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  52.57 
 
 		 263 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  52.57 
 
 		 263 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  52.57 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  52.57 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  33.74 
 
 		 628 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  33.9 
 
 		 628 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  30.12 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  30.64 
 
 		 280 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  26.61 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  26.83 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  25.93 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  24.51 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  24.3 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  26.25 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  23.6 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  26.27 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  24.1 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  25 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  25.63 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  24.7 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  23.08 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  21.71 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.69 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  25 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  25.2 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  25.2 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  23.85 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  22.86 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  25.2 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.8 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  25.2 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.69 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.39 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  24.9 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.63 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.8 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.59 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  24.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.43 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  24.69 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  24.28 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  23.77 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  23.77 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  23.77 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  23.77 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  23.77 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  23.77 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.77 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  24.42 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  22.79 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  24.29 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  23.17 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  23.87 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  19.72 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  22.22 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  24.91 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  25 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  23.36 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  24.9 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  21.4 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  22.97 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  20.58 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.42 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.6 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  22.37 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  24.66 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.65 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  21.51 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  19.39 
 
 		 300 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  22.37 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  21.52 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  28.12 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.54 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  22.11 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  25.11 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.99 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  24.43 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  22.58 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  22.58 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  22.58 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  20.74 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  20.81 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  24.12 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  26.54 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  23.08 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  22.27 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  20.88 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  25.43 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>