62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0093 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  39.68 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  40.16 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  33.62 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  34.35 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  39.84 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  32.17 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  32.17 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  32.48 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  32.76 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  28.21 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  33.7 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  34.17 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  33.9 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  36.76 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  26.96 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  32.77 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  24.19 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  28.1 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  31.9 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  33.01 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  31.2 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  28.33 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  28.21 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  29.06 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  26.83 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.380561  hitchhiker  0.0000591661 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.172817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  23.73 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  29.01 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  25.42 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  26.02 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  24.17 
 
 		 242 aa  48.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  34.78 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  25.83 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  28.32 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  26.32 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  29.75 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  28.21 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1016  hypothetical protein  28.43 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.041668  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0896  hypothetical protein  35.19 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  21.19 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  28.1 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  21.54 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  24.58 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  24.79 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  30.83 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  28.33 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  24.39 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  26.67 
 
 		 145 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  25.6 
 
 		 151 aa  40.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  20.61 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  25.2 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  22.12 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  37.78 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>